Lykilmunurinn á milli 1D og 2D hlaup rafskautar er eiginleikarnir sem notaðir eru til aðgreiningar próteina á rafskautinu í hlaupinu. 1D hlaup rafskaut aðskilur aðeins prótein sem byggjast á mólmassa meðan 2D gel rafskaut skilur prótein út frá samsvarandi rafmagns punkti og mólmassa.

Aðskilnaður próteina með rafskautum í hlaupi er mikilvæg aðferð til að einkenna prótein. Prótein hafa mismunandi eiginleika; Þess vegna er aðskilnaður flóknari í samanburði við DNA-aðskilnað með rafsegju Agarósageli.

INNIHALD

1. Yfirlit og lykilmunur
2. Hvað er 1D Gel rafskaut
3. Hvað er 2D Gel rafskaut
4. Líkindi á milli 1D og 2D Gel rafskaut
5. Samanburður á hlið við hlið - 1D vs 2D Gel rafskaut í töfluformi
6. Yfirlit

Hvað er 1D Gel rafskaut?

1D Gel rafskaut, einnig þekkt sem rafvídd gelar í einum vídd, er aðferð til að aðgreina prótein sem byggist á mólmassa. Aðgreining próteina fer aðallega fram með pólýakrýlamíð hlaup rafskoðun. Byggt á hugmyndinni um rafskaut hlaup, aðskiljast sameindir eftir eiginleikum mólmassa og hleðslu.

Þess vegna er meðferð með natríum dodecyl súlfat (SDS) til að gefa próteinin jafna hleðslu áður en hlaup rafskautið er notað. SDS afneytir prótein og veitir samræmda neikvæða hleðslu á próteininu; þegar beiting rafmagnssviðsins fer fram flytjast próteinin yfir í jákvæða flugstöðina miðað við mólmassa þeirra. Þannig er í aðskilnaði aðeins ein eign talin. Þetta er ástæðan fyrir því að þessi aðferð er kölluð 1D gel rafskaut.

Við rafskaut á 1D hlaupi eru prótein aðskilin út frá mólþunga þeirra. Í þessu sambandi flytjast sameindir með lægri þyngd hraðar í hlaupinu samanborið við prótein með mikla mólþunga. Þannig eru prótein með mikla þyngd áfram nálægt holunum.

Hvað er 2D hlaup rafskaut?

2D hlaup rafskaut eða tvívídd hlaup rafskaut skilur prótein út frá tveimur eiginleikum. Þessir tveir eiginleikar eru ísó-rafmagns punktur próteins og mólmassa. Þessi aðferð við aðskilnað próteina eykur upplausn próteinsskilnaðar. Ísó-rafknúinn punktur próteinsins fer eftir sýrustigi þar sem próteinið er hlutlaust.

Þannig, í 2D hlaup rafskautum, er prótíninu leyft að keyra á föstu pH stigi í fyrstu víddinni. Í annarri víddinni eru próteinin aðskilin með því að nota lóðrétta eða lárétta pólýakrýlamíð gel rafskaut. Þannig að próteinin skilja sig eftir mólmassa þeirra í annarri víddinni.

Að auki eykur þessi aðferð við rafskaut hlaup upplausn próteinsskilnaðar. Þess vegna eru aðskildu próteinin hreinni. Samt sem áður er kostnaðurinn við tæknina miklu hærri en gelvíddarafrit.

Hver eru líkt á milli 1D og 2D Gel rafskaut?

  • Báðar aðferðirnar aðgreina prótein. Þess vegna eru þau mikilvæg við að lýsa próteinum.

Hver er munurinn á 1D og 2D hlaup rafskautum?

Lykilmunurinn á 1D og 2D hlaup rafskautinu er sá að 1D hlaup rafskaut skilur prótein byggð eingöngu á mólmassa meðan 2D gel rafskaut skilur prótein sem byggjast á bæði raf-og mergþyngd. Vegna þessa grundvallarmismunar á 1D og 2D hlaup rafskautum er breyting á aðskilnaði próteina og kostnaður við þessar tvær aðferðir einnig breytileg. 2D hlaup rafskaut sýnir mikla upplausn en 1D hlaup rafskaut. Samt sem áður er rafskaut á 2D hlaupi dýrara en 1D gel rafskaut.

Hér að neðan lýsir upplýsingamunur muninum á 1D og 2D hlaup rafskoðun.

Mismunur á milli 1D og 2D Gel rafskaut í töfluformi

Samantekt - 1D vs 2D Gel rafskaut

Aðskilnaður próteina byggir á mörgum þáttum. 1D hlaup rafskaut aðskilur prótein byggð eingöngu á mólmassa. Tvívíð eða 2D hlaup rafskaut eykur hins vegar upplausn próteinsskilnaðarins. Ennfremur aðskilur 2D hlaup rafskaut prótein sem byggjast á ísó-rafknúnum punkti og mólmassa. Þess vegna eru þessi gögn mikilvæg fyrir vinnslu á próteinum og á sviði prótínfræði. Þannig er þetta yfirlit yfir muninn á 1D og 2D hlaup rafskoðun.

Tilvísun:

1. Galeva, Nadezhda og MichailAltermann. „Samanburður á einsvíddar og tvívíddum hlaupafleki sem aðgreiningarverkfæri fyrir prótómagreiningu á rottum í lifur: Sýtókróm P450 og önnur himnurprótein.“ Proteomics, U.S. National Library of Medicine, júní 2002, fáanlegt hér.

Mynd kurteisi:

1. „Electrophoresis - Fylling 1D hlaupholna með próteinblöndu“ Eftir Jean-Etienne Poirrier - Fylling 1D hlaupholna með próteinblöndu (CC BY-SA 2.0) í gegnum Commons Wikimedia
2. „2D rafskaut“ af National Institute of Health - Center for Cancer Research Nanobiology Program, National Institute of Health (Public Domain) via Commons Wikimedia